При загрузке системы сразу же появляются окна с ошибками в которых написано следующее — Программа не является приложением Win32

То же самое происходит и при запуске абсолютно любой программы — снова появляется сообщение — Программа не является приложением Win32.

Это могло произойти как при работе какого нибудь вируса, либо  вы сами могли нарушить ассоциации exe файлов, попытавшись открыть программу с помощью какого-либо приложения не сняв при этом галочку с пункта — использовать приложения для всех файлов данного типа. Правда во-втором случае при открытии любых программ запускается приложение, которое вы связали с данным типом файлов. Поэтому на данное сообщение — Программа не является приложением Win32, скорее всего повлияла вредоносная программа.

Для Windows 7 программу все таки можно запустить от имени администратора (правой кнопкой мыши на программе — запуск от имени администратора), на Windows XP не пробовал. Но ведь это не дело — запускать каждый раз программу с такими манипуляциями.

Для того чтобы вернуть все на место можете воспользоваться статьей Восстановление ассоциаций reg, exe и lnk файлов. Все что вам нужно сохранить файл реестра для exe файлов и запустить его, согласившись с правкой.

Также можно воспользоваться программой AVZ — выбрав в нем пункт  Поиск и удаление проблем — и последующим фиксом пункта Нарушена ассоциация EXE файлов.